Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SnupnQ80W37 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SnupnQ80W37 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SnupnQ80W37 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SnupnQ80W37 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SnupnQ80W37 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms