Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc93Q7TQK5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc93Q7TQK5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc93Q7TQK5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc93Q7TQK5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc93Q7TQK5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc93Q7TQK5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc93Q7TQK5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms