Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Sbno2Q7TNB8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sbno2Q7TNB8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sbno2Q7TNB8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sbno2Q7TNB8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sbno2Q7TNB8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sbno2Q7TNB8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sbno2Q7TNB8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sbno2Q7TNB8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Sbno2Q7TNB8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Sbno2Q7TNB8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sbno2Q7TNB8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Sbno2Q7TNB8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Sbno2Q7TNB8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sbno2Q7TNB8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sbno2Q7TNB8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sbno2Q7TNB8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms