Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TwistnbQ78WZ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TwistnbQ78WZ7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TwistnbQ78WZ7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TwistnbQ78WZ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TwistnbQ78WZ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TwistnbQ78WZ7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms