Protein–RNA interactions for Protein: Q70E20

Sned1, Sushi, nidogen and EGF-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sned1Q70E20 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Sned1Q70E20 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Sned1Q70E20 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Sned1Q70E20 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Sned1Q70E20 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Sned1Q70E20 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Sned1Q70E20 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms