Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Usp34Q6ZQ93 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Usp34Q6ZQ93 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp34Q6ZQ93 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Usp34Q6ZQ93 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp34Q6ZQ93 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Usp34Q6ZQ93 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Usp34Q6ZQ93 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp34Q6ZQ93 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Usp34Q6ZQ93 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp34Q6ZQ93 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Usp34Q6ZQ93 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Usp34Q6ZQ93 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Usp34Q6ZQ93 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Usp34Q6ZQ93 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 280.7 ms