Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd300ld3Q6SJQ5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd300ld3Q6SJQ5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd300ld3Q6SJQ5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms