Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIJ4

Nfrkb, Nuclear factor related to kappa-B-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfrkbQ6PIJ4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NfrkbQ6PIJ4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NfrkbQ6PIJ4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NfrkbQ6PIJ4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NfrkbQ6PIJ4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NfrkbQ6PIJ4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NfrkbQ6PIJ4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms