Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Prrt3Q6PE13 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Prrt3Q6PE13 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Prrt3Q6PE13 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Prrt3Q6PE13 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms