Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDJ6

Fbxo42, F-box only protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo42Q6PDJ6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Fbxo42Q6PDJ6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fbxo42Q6PDJ6 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fbxo42Q6PDJ6 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Fbxo42Q6PDJ6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fbxo42Q6PDJ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms