Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep78Q6IRU7 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep78Q6IRU7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cep78Q6IRU7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cep78Q6IRU7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep78Q6IRU7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms