Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

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Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdzrn3Q69ZS0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Pdzrn3Q69ZS0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Pdzrn3Q69ZS0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Pdzrn3Q69ZS0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Pdzrn3Q69ZS0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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