Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80dQ66JY2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ino80dQ66JY2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80dQ66JY2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ino80dQ66JY2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80dQ66JY2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ino80dQ66JY2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ino80dQ66JY2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ino80dQ66JY2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ino80dQ66JY2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ino80dQ66JY2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms