Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ifit1Q64282 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ifit1Q64282 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ifit1Q64282 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ifit1Q64282 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ifit1Q64282 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms