Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pan3Q640Q5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pan3Q640Q5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Pan3Q640Q5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Pan3Q640Q5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms