Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sema4aQ62178 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sema4aQ62178 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Sema4aQ62178 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Sema4aQ62178 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Sema4aQ62178 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms