Protein–RNA interactions for Protein: Q62059

Vcan, Versican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VcanQ62059 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VcanQ62059 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VcanQ62059 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VcanQ62059 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VcanQ62059 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VcanQ62059 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcanQ62059 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VcanQ62059 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VcanQ62059 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VcanQ62059 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VcanQ62059 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VcanQ62059 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VcanQ62059 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcanQ62059 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
VcanQ62059 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VcanQ62059 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VcanQ62059 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VcanQ62059 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VcanQ62059 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VcanQ62059 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VcanQ62059 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VcanQ62059 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcanQ62059 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcanQ62059 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcanQ62059 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcanQ62059 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VcanQ62059 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms