Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pacsin1Q61644 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Pacsin1Q61644 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pacsin1Q61644 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pacsin1Q61644 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pacsin1Q61644 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms