Protein–RNA interactions for Protein: Q61093

Cybb, Cytochrome b-245 heavy chain, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CybbQ61093 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CybbQ61093 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CybbQ61093 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CybbQ61093 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CybbQ61093 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CybbQ61093 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CybbQ61093 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CybbQ61093 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CybbQ61093 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CybbQ61093 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CybbQ61093 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CybbQ61093 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CybbQ61093 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CybbQ61093 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CybbQ61093 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CybbQ61093 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CybbQ61093 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CybbQ61093 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CybbQ61093 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CybbQ61093 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CybbQ61093 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CybbQ61093 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CybbQ61093 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CybbQ61093 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CybbQ61093 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CybbQ61093 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CybbQ61093 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CybbQ61093 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CybbQ61093 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CybbQ61093 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CybbQ61093 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CybbQ61093 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CybbQ61093 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CybbQ61093 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CybbQ61093 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CybbQ61093 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CybbQ61093 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms