Protein–RNA interactions for Protein: Q61033

Tmpo, Lamina-associated polypeptide 2, isoforms alpha/zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TmpoQ61033 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TmpoQ61033 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TmpoQ61033 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TmpoQ61033 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TmpoQ61033 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TmpoQ61033 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TmpoQ61033 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TmpoQ61033 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TmpoQ61033 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TmpoQ61033 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TmpoQ61033 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TmpoQ61033 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TmpoQ61033 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC30■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TmpoQ61033 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TmpoQ61033 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TmpoQ61033 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TmpoQ61033 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TmpoQ61033 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TmpoQ61033 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TmpoQ61033 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TmpoQ61033 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TmpoQ61033 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TmpoQ61033 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms