Protein–RNA interactions for Protein: Q60738

Slc30a1, Zinc transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc30a1Q60738 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Slc30a1Q60738 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc30a1Q60738 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc30a1Q60738 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc30a1Q60738 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms