Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Psmb6Q60692 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Psmb6Q60692 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Psmb6Q60692 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.4 ms