Protein–RNA interactions for Protein: Q5U462

Cdcp1, CUB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdcp1Q5U462 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdcp1Q5U462 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cdcp1Q5U462 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdcp1Q5U462 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdcp1Q5U462 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdcp1Q5U462 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdcp1Q5U462 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdcp1Q5U462 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Cdcp1Q5U462 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdcp1Q5U462 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdcp1Q5U462 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdcp1Q5U462 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Cdcp1Q5U462 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms