Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
DroshaQ5HZJ0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC33.77■■■■□ 3
DroshaQ5HZJ0 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
DroshaQ5HZJ0 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
DroshaQ5HZJ0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
DroshaQ5HZJ0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
DroshaQ5HZJ0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DroshaQ5HZJ0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
DroshaQ5HZJ0 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
DroshaQ5HZJ0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
DroshaQ5HZJ0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
DroshaQ5HZJ0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
DroshaQ5HZJ0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
DroshaQ5HZJ0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
DroshaQ5HZJ0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DroshaQ5HZJ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
DroshaQ5HZJ0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DroshaQ5HZJ0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
DroshaQ5HZJ0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
DroshaQ5HZJ0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
DroshaQ5HZJ0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
DroshaQ5HZJ0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
DroshaQ5HZJ0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
DroshaQ5HZJ0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
DroshaQ5HZJ0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
DroshaQ5HZJ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
DroshaQ5HZJ0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
DroshaQ5HZJ0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC33.45■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
DroshaQ5HZJ0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
DroshaQ5HZJ0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.6 ms