Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Rhox3aQ4TU90 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rhox3aQ4TU90 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Rhox3aQ4TU90 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Rhox3aQ4TU90 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rhox3aQ4TU90 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms