Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Shank3Q4ACU6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Shank3Q4ACU6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shank3Q4ACU6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Shank3Q4ACU6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shank3Q4ACU6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Shank3Q4ACU6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Shank3Q4ACU6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Shank3Q4ACU6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Shank3Q4ACU6 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Shank3Q4ACU6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Shank3Q4ACU6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Shank3Q4ACU6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Shank3Q4ACU6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Shank3Q4ACU6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Shank3Q4ACU6 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms