Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Defa20Q45VN2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Defa20Q45VN2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Defa20Q45VN2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms