Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snx25Q3ZT31 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snx25Q3ZT31 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Snx25Q3ZT31 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Snx25Q3ZT31 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Snx25Q3ZT31 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
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