Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0E1

Uncharacterized protein C9orf131 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3V0E1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3V0E1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3V0E1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3V0E1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3V0E1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Q3V0E1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3V0E1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3V0E1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3V0E1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q3V0E1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3V0E1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q3V0E1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3V0E1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3V0E1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3V0E1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3V0E1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3V0E1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3V0E1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q3V0E1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms