Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prom2Q3UUY6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prom2Q3UUY6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Prom2Q3UUY6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prom2Q3UUY6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Prom2Q3UUY6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prom2Q3UUY6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Prom2Q3UUY6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Prom2Q3UUY6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Prom2Q3UUY6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Prom2Q3UUY6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Prom2Q3UUY6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Prom2Q3UUY6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Prom2Q3UUY6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prom2Q3UUY6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prom2Q3UUY6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Prom2Q3UUY6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Prom2Q3UUY6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms