Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm29609Q3UU56 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm29609Q3UU56 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gm29609Q3UU56 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm29609Q3UU56 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm29609Q3UU56 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm29609Q3UU56 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms