Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsg1Q3UM18 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsg1Q3UM18 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lsg1Q3UM18 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lsg1Q3UM18 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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