Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULQ2

Pin1rt1, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Pin1rt1Q3ULQ2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pin1rt1Q3ULQ2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Pin1rt1Q3ULQ2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pin1rt1Q3ULQ2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 314.4 ms