Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CrxosQ3UL53 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CrxosQ3UL53 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CrxosQ3UL53 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CrxosQ3UL53 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CrxosQ3UL53 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms