Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL33

E330014E10Rik, Predicted gene 3286, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330014E10RikQ3UL33 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E330014E10RikQ3UL33 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
E330014E10RikQ3UL33 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
E330014E10RikQ3UL33 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
E330014E10RikQ3UL33 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
E330014E10RikQ3UL33 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms