Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccdc34Q3UI66 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc34Q3UI66 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc34Q3UI66 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc34Q3UI66 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms