Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atxn7l3bQ3UD01 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atxn7l3bQ3UD01 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Atxn7l3bQ3UD01 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Atxn7l3bQ3UD01 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms