Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0K8

Ogfod1, Prolyl 3-hydroxylase OGFOD1, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ogfod1Q3U0K8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ogfod1Q3U0K8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ogfod1Q3U0K8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ogfod1Q3U0K8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Ogfod1Q3U0K8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ogfod1Q3U0K8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Ogfod1Q3U0K8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ogfod1Q3U0K8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ogfod1Q3U0K8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ogfod1Q3U0K8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ogfod1Q3U0K8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ogfod1Q3U0K8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ogfod1Q3U0K8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ogfod1Q3U0K8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms