Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX3

Zfyve27, Protrudin, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfyve27Q3TXX3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zfyve27Q3TXX3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Zfyve27Q3TXX3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfyve27Q3TXX3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfyve27Q3TXX3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms