Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM4

Pnpla6, Neuropathy target esterase, mousemouse

Predictions only

Length 1,355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnpla6Q3TRM4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Pnpla6Q3TRM4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Pnpla6Q3TRM4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pnpla6Q3TRM4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pnpla6Q3TRM4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pnpla6Q3TRM4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Pnpla6Q3TRM4 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Pnpla6Q3TRM4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Pnpla6Q3TRM4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pnpla6Q3TRM4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pnpla6Q3TRM4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pnpla6Q3TRM4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Pnpla6Q3TRM4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms