Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL44

Nlrx1, NLR family member X1, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrx1Q3TL44 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nlrx1Q3TL44 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nlrx1Q3TL44 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nlrx1Q3TL44 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Nlrx1Q3TL44 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrx1Q3TL44 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrx1Q3TL44 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrx1Q3TL44 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrx1Q3TL44 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Nlrx1Q3TL44 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms