Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pdlim7Q3TJD7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pdlim7Q3TJD7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdlim7Q3TJD7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdlim7Q3TJD7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdlim7Q3TJD7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdlim7Q3TJD7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdlim7Q3TJD7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdlim7Q3TJD7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdlim7Q3TJD7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdlim7Q3TJD7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdlim7Q3TJD7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdlim7Q3TJD7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdlim7Q3TJD7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdlim7Q3TJD7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdlim7Q3TJD7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdlim7Q3TJD7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdlim7Q3TJD7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pdlim7Q3TJD7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Pdlim7Q3TJD7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms