Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hddc2Q3SXD3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hddc2Q3SXD3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hddc2Q3SXD3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hddc2Q3SXD3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hddc2Q3SXD3 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms