Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF58

Col19a1, Collagen alpha-1(XIX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col19a1Q0VF58 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Col19a1Q0VF58 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Col19a1Q0VF58 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Col19a1Q0VF58 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Col19a1Q0VF58 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Col19a1Q0VF58 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Col19a1Q0VF58 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms