Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpne7Q0VE82 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cpne7Q0VE82 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cpne7Q0VE82 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpne7Q0VE82 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpne7Q0VE82 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 147.5 ms