Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
MitfQ08874 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
MitfQ08874 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
MitfQ08874 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MitfQ08874 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
MitfQ08874 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
MitfQ08874 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
MitfQ08874 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
MitfQ08874 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MitfQ08874 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
MitfQ08874 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MitfQ08874 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MitfQ08874 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MitfQ08874 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MitfQ08874 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MitfQ08874 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MitfQ08874 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MitfQ08874 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms