Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cntn3Q07409 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntn3Q07409 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntn3Q07409 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntn3Q07409 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntn3Q07409 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.8 ms