Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gdf3Q07104 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gdf3Q07104 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gdf3Q07104 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gdf3Q07104 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms