Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Prrx2Q06348 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Prrx2Q06348 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Prrx2Q06348 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Prrx2Q06348 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prrx2Q06348 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms