Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Crisp3Q03402 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Crisp3Q03402 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Crisp3Q03402 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Crisp3Q03402 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms